临床医学院是学校规模最大、办学历史最长的教学单位。前身为创设于1987年的临床医学系，2003年更名为临床学院，2014年调整设立第一临床学院，2015年确定为临床医学院。学院目前在校本科生3260人，研究生737人，下设6个行政科室，14个教研室，拥有14所直属、非直属附属医院和教学医院。学院现有专任教师316人，其中教授117人，副教授81人，具有博士学位教师143人，具有硕士学位教师153人。

临床医学专业是学校优势品牌专业，1952年学校建校之初设立医士专业，1958年招收第一届医疗专业本科生，1987年开始连续招收临床医学专业五年制本科生，专业先后获批省级改革试点专业、国家级特色专业建设点、服务国家特殊需求人才培养项目、教育部“卓越医生教育培养计划”试点单位、教育部地方高校第一批本科专业综合改革试点专业、山东省应用型人才培养专业发展支持计划项目、山东省高水平应用型立项建设重点专业群、山东省一流本科专业建设点、国家一流本科专业建设点，临床医学专业认证有效期为10年（2015-2025）。2020年临床医学进入ESI全球前1%行列，2024年进入全球前5‰。

培养高素质应用型医学人才是临床医学院全院上下的共识。临床医学专业拥有国家一流本科课程2门，省一流本科课程22门，主编、副主编国家级教材12部。在省内率先组建“圣地卓越医师班”，开展器官系统化教学，成立临床整合课程中心，联合基础医学院组建了临床病理、临床病理生理和临床药理3个教学中心，完成了16门基础与临床课程整合，构建了14个整合课程模块，打造了11个基础-临床跨学科教学团队。相关教学成果先后获国家教学成果二等奖2项，省级教学成果一、二等奖6项。

学院注重强化学生综合能力培养，学生获全国大学生基础医学创新研究二等奖、全国大学生生命科学竞赛二等奖、全国大学生临床技能大赛总决赛二等奖、华东赛区一等奖、山东省大学生医学技术技能大赛临床医学专业赛道B队特等奖等省部级奖励近百项。近年来，学院本科毕业生国家执业医师考试一次性通过率均高于全国平均水平。

针对考研和就业，学院常态化开展“伴飞行动”，学生考研录取率逐年攀升，2024年达48.32%，近1/3被北京协和医学院、北京大学等双一流高校录取，1人被大阪公立大学、1人被密歇根大学迪尔伯恩分校录取。近五年临床医学专业本科毕业生就业率达90%以上。