医学信息工程学院成立于2003 年，坐落于美丽沿海城市日照，现拥有计算机科学与技术、生物医学工程、医学信息工程、信息管理与信息系统4个专业。计算机科学与技术专业是山东省一流专业，山东省卓越工程师教育培养计划、校级特色专业；生物医学工程是山东省一流专业。2016 年3月成立济宁医学院健康大数据研究中心，创建有“智慧医疗协同创新平台。实验教学用房总面积 4500 余平方米，教学科研仪器设备总值 3200 余万元。      

现有专任教师65人。 其中教授5人，副教授32人，博士 22人，在读博士1人，硕士41人。有全国优秀教师、教学名师、全国大数据创新百人、五一劳动奖章获得者。近5年在国内外核心刊物上发表学术论文200篇，其中SCI、EI等收录近100篇，ESI高被引论文5篇。主持或参加国家自然科学基金项目14项，山东省自然科学基金、省科技攻关计划等课题20项 ；教育部产教融合项目10余项，主持山东省教育规划课题等10项。获省科技进步奖、省级优秀教学成果奖、省高校科研成果奖等36项。